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建設粵港澳大灣區作為國家重要的戰略舉措，是我國落實國家創新驅動發展戰略、加快建設世界科技強國的必然要求。但與世界級的大灣區相比，粵港澳大灣區在不同城市的協同發展以及整體的創新能力方面依然有待提升。智慧專業化理論作為近年來新湧現的區域創新理論，在歐盟各國的創新實踐中發揮了重要的指揮棒作用。在將粵港澳大灣區打造成世界創新高地的進程中，可遵循智慧專業化的戰略邏輯，有效實現大灣區各城市群在創新中的協同發展，避免創新活動中因重複投入而造成的資源浪費，並擺脫產業的同質化發展陷阱，從而更高效和科學地利用政府在研究開發、創新方面的公共資源。將創新資源更多地投入到提升大灣區的知識資源，形成大灣區各個城市的獨特專業化能力，提升大灣區整體的創新發展能力。